Miyagi ve Daniel, Miyagi'nin ölmekte olan babasını ziyaret etmek için birlikte Okinawa'ya gider. Miyagi oraya vardığında hâlâ eski aşkına karşı hisleri olduğunu fark eder. Ayrıca eskiden kalma bir rakibiyle de karşı karşıya gelir. Öte yandan Daniel yeni bir aşka yelken açarken güçlü düşmanlar edinmiştir...

Tokyo giderek artan canavar saldırılarıyla kuşatılırken beyzbol yıldızı olan Ken Sato, Ultraman görevini üstlenmek için memleketine gönülsüzce geri döner. Fakat devasa süper kahramanımız, ateş püskürten ve 10 metre uzunluğunda olan bebek kaiju'yu evlat edinmek zorunda kaldığında şok olur. Sato, bir yandan hem işi hem de ebeveynliği egosuna yenik düşmeden bir arada yürütmelidir, bir yandan da kötü planları için bebeği kullanmak isteyen güçlerden onu korumak zorundadır...